Собственно, вот

Можно ли рассматривать поезд длиной 200 м как материальную точку при определенном времени, за которое он проехал расстояние 2 м?

Можно, исходя из определения материальной точки - это тело размерами и формой которого можно пренебречь

Нет. Длина самого поезда гораздо больше проеханного расстояния. Здесь его размерами и формой нельзя пренебречь.

Дополнение: Вот если бы поезд проезжал расстояние, гораздо большее длины его самого, тогда можно (Например, при движении между станциями).