Тело состоит из вещества, вещества из молекул, молекулы из атомов, атомы из протонов, электронов и нейтронов. Вопрос: из чего состоят протоны, электроны и нейтроны?

давай считать, что тело сразу состоит из молекул. Вещества - это лишнее.

протоны, электроны и прочие элементарные частицы - из кварков. Есть такая теория.

Дальше можно представить всё в виде колебаний n-мерного пространства. Струнная теория называется. Красиво, но ничего полезного не предсказывает