Чем отличаются друг от друга химические элементы

Структурой. Ядрами, нейтронами, изотопами, атомами и т. д. и т. п.

Разные химические элементы отличаются друг от друга зарядом ядра, т. е. количеством протонов в ядре атома

Другое количество нейтронов дают другой изотоп, но того же самого элемента. Точно так при другом количество электронов на оболочках будет ион, но того же самого элемента.