Одна молекула кислорода в воздухе движется в данный момент со скоростью 90 м/с, а другая - со скоростью 1200 м/с. правильным ли будет утверждение, что температура второй молекулы выше?

Нет, конечно. Просто кинетическая энергия ее выше. Величина температура относится к самому газу, где множество таких молекул, и они движутся с разными скоростями. Средняя скорость всех молекул газа нам дает представление о температуре