чем циста отличается от споры

Отличия:

Спора - это рамножения или споры бактерий пережидания неблагоприятных условий.

Циста - это форма существования обычно паразитов.

Циста это одна из стадий развития (чаще всего паразита), а спора - приспособление для переживания неблагоприятных условий, (у бактерий), спора может быть, а может и не образовываться (если неблагоприятных условий нет), а циста будет всегда, т. к. без неё невозможно продолжить развитие.