Являются ли слова микроб и микроскоп близкими по значению?

Нет, потому что слово микроб значит, ну тоесть какая нибуть бактерия.

А микроскоп для того что бы увидеть какое нибуть вещество, которое недоступно для наших глаз.

Они не близкие по значению, даже если у них одинаковый корень!