маргаритки, тюльпаны, ромашки - это имена собственные?

Нет конечно, это названия цветка (нариц сущ) А вот сорт цветка (написан на пакете с семенами) будет с заглавной буквы (тюльпан Триумф) Породы собак тоже нарицательные существительные-пишем с маленькой буквы, а вот кличку - с большой (спаниэль Тошка)

Маргаритки - если имеется ввиду цветы, то имя нарицательное, а если несколько женьщин, девочек или девушек, то собственное.

Тюльпаны и ромашки - имена нарицательные.