Глагол погоните 2-го спряжения, так как это глагол исключение, но почему подгоняешь 1-го спряжения?

Разные смысловые значение:

Подгоняешь (подгонять) т. е заставлять

Подгонять стадо к коровнику/Портной подгоняет платье по фигуре (подгон)

А гнать (погоните), тут уже будет от слова гнать, т. е в смысле поскакать.

Думаю, что более или менее понятно объяснил