Как правильно, fish live in the sea или fish lives in the sea

Правильно первое и второе.

Первое - если мн. ч

Второе - если ед. ч

В принципе оба, т. к. слово может употребляться в единственном числе как во множественном (из этой же серии deer, fruit). Но если это единственное число и существительное исчисляемое, то должен быть артикль. Во втором предложении его нет и это ошибка. Поэтому только первый вариант: Fish live in the sea. (рыбы живут в воде).